Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HACD3Q9P035 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HACD3Q9P035 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms