Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ARHGEF12Q9NZN5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ARHGEF12Q9NZN5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ARHGEF12Q9NZN5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ARHGEF12Q9NZN5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ARHGEF12Q9NZN5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
ARHGEF12Q9NZN5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ARHGEF12Q9NZN5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
ARHGEF12Q9NZN5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ARHGEF12Q9NZN5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
ARHGEF12Q9NZN5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ARHGEF12Q9NZN5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ARHGEF12Q9NZN5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ARHGEF12Q9NZN5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ARHGEF12Q9NZN5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ARHGEF12Q9NZN5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
ARHGEF12Q9NZN5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ARHGEF12Q9NZN5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ARHGEF12Q9NZN5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ARHGEF12Q9NZN5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
ARHGEF12Q9NZN5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
ARHGEF12Q9NZN5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ARHGEF12Q9NZN5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ARHGEF12Q9NZN5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ARHGEF12Q9NZN5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ARHGEF12Q9NZN5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ARHGEF12Q9NZN5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ARHGEF12Q9NZN5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
ARHGEF12Q9NZN5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ARHGEF12Q9NZN5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ARHGEF12Q9NZN5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ARHGEF12Q9NZN5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ARHGEF12Q9NZN5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ARHGEF12Q9NZN5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ARHGEF12Q9NZN5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
ARHGEF12Q9NZN5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ARHGEF12Q9NZN5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ARHGEF12Q9NZN5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ARHGEF12Q9NZN5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ARHGEF12Q9NZN5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
ARHGEF12Q9NZN5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
ARHGEF12Q9NZN5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ARHGEF12Q9NZN5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ARHGEF12Q9NZN5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
ARHGEF12Q9NZN5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
ARHGEF12Q9NZN5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ARHGEF12Q9NZN5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ARHGEF12Q9NZN5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ARHGEF12Q9NZN5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ARHGEF12Q9NZN5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
ARHGEF12Q9NZN5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ARHGEF12Q9NZN5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ARHGEF12Q9NZN5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ARHGEF12Q9NZN5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ARHGEF12Q9NZN5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ARHGEF12Q9NZN5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ARHGEF12Q9NZN5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ARHGEF12Q9NZN5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ARHGEF12Q9NZN5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ARHGEF12Q9NZN5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ARHGEF12Q9NZN5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ARHGEF12Q9NZN5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ARHGEF12Q9NZN5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ARHGEF12Q9NZN5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ARHGEF12Q9NZN5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms