Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNIP1Q9NZI2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNIP1Q9NZI2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNIP1Q9NZI2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms