Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO1C1Q9NYB5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO1C1Q9NYB5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO1C1Q9NYB5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO1C1Q9NYB5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO1C1Q9NYB5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO1C1Q9NYB5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO1C1Q9NYB5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO1C1Q9NYB5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO1C1Q9NYB5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO1C1Q9NYB5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO1C1Q9NYB5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO1C1Q9NYB5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO1C1Q9NYB5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO1C1Q9NYB5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO1C1Q9NYB5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO1C1Q9NYB5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLCO1C1Q9NYB5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms