Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDL2Q9NX52 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDL2Q9NX52 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms