Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms