Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBCCD1Q9NVR7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBCCD1Q9NVR7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TBCCD1Q9NVR7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCCD1Q9NVR7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms