Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL11Q9NVR0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL11Q9NVR0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms