Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASF1BQ9NVP2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms