Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV56

MRGBP, MRG/MORF4L-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRGBPQ9NV56 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRGBPQ9NV56 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRGBPQ9NV56 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRGBPQ9NV56 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms