Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPPQ9NTK1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPPQ9NTK1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms