Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC22A11Q9NSA0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A11Q9NSA0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A11Q9NSA0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms