Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GKN1Q9NS71 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GKN1Q9NS71 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GKN1Q9NS71 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GKN1Q9NS71 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms