Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PDLIM7Q9NR12 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDLIM7Q9NR12 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms