Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SEC31BQ9NQW1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
SEC31BQ9NQW1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SEC31BQ9NQW1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SEC31BQ9NQW1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SEC31BQ9NQW1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms