Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ34

TMEM9B, Transmembrane protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9BQ9NQ34 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM9BQ9NQ34 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM9BQ9NQ34 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM9BQ9NQ34 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM9BQ9NQ34 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM9BQ9NQ34 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM9BQ9NQ34 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM9BQ9NQ34 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM9BQ9NQ34 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms