Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM138Q9NPI0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms