Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC1

LTB4R2, Leukotriene B4 receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB4R2Q9NPC1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTB4R2Q9NPC1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTB4R2Q9NPC1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTB4R2Q9NPC1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTB4R2Q9NPC1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTB4R2Q9NPC1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTB4R2Q9NPC1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTB4R2Q9NPC1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTB4R2Q9NPC1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTB4R2Q9NPC1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTB4R2Q9NPC1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTB4R2Q9NPC1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTB4R2Q9NPC1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTB4R2Q9NPC1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTB4R2Q9NPC1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LTB4R2Q9NPC1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTB4R2Q9NPC1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms