Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMX1Q9NP08 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMX1Q9NP08 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HMX1Q9NP08 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMX1Q9NP08 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMX1Q9NP08 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMX1Q9NP08 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMX1Q9NP08 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMX1Q9NP08 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMX1Q9NP08 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMX1Q9NP08 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMX1Q9NP08 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMX1Q9NP08 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMX1Q9NP08 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMX1Q9NP08 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMX1Q9NP08 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMX1Q9NP08 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMX1Q9NP08 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HMX1Q9NP08 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMX1Q9NP08 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms