Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARVBQ9HBI1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARVBQ9HBI1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARVBQ9HBI1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms