Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAV7

GRPEL1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRPEL1Q9HAV7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRPEL1Q9HAV7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GRPEL1Q9HAV7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRPEL1Q9HAV7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRPEL1Q9HAV7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRPEL1Q9HAV7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRPEL1Q9HAV7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRPEL1Q9HAV7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRPEL1Q9HAV7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRPEL1Q9HAV7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms