Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIN28AQ9H9Z2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIN28AQ9H9Z2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN28AQ9H9Z2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms