Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ELP3Q9H9T3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ELP3Q9H9T3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ELP3Q9H9T3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms