Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNDIG1Q9H7V2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNDIG1Q9H7V2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNDIG1Q9H7V2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms