Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SCAF1Q9H7N4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SCAF1Q9H7N4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SCAF1Q9H7N4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SCAF1Q9H7N4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms