Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNCQ9H7C4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYNCQ9H7C4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNCQ9H7C4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms