Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5N1

RABEP2, Rab GTPase-binding effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP2Q9H5N1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RABEP2Q9H5N1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RABEP2Q9H5N1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RABEP2Q9H5N1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms