Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2H9

SLC38A1, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A1Q9H2H9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC38A1Q9H2H9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC38A1Q9H2H9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A1Q9H2H9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms