Protein–RNA interactions for Protein: Q9H254

SPTBN4, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN4Q9H254 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPTBN4Q9H254 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTBN4Q9H254 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPTBN4Q9H254 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPTBN4Q9H254 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTBN4Q9H254 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTBN4Q9H254 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTBN4Q9H254 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTBN4Q9H254 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTBN4Q9H254 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTBN4Q9H254 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBN4Q9H254 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBN4Q9H254 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBN4Q9H254 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBN4Q9H254 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBN4Q9H254 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTBN4Q9H254 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.5 ms