Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG10Q9H0Y0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG10Q9H0Y0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG10Q9H0Y0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms