Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB17Q9H0T7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB17Q9H0T7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB17Q9H0T7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB17Q9H0T7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB17Q9H0T7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB17Q9H0T7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB17Q9H0T7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB17Q9H0T7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB17Q9H0T7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB17Q9H0T7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB17Q9H0T7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB17Q9H0T7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB17Q9H0T7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB17Q9H0T7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB17Q9H0T7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB17Q9H0T7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB17Q9H0T7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB17Q9H0T7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB17Q9H0T7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms