Protein–RNA interactions for Protein: Q9H009

NACA2, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACA2Q9H009 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NACA2Q9H009 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NACA2Q9H009 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NACA2Q9H009 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms