Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN2Q9H000 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN2Q9H000 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN2Q9H000 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN2Q9H000 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN2Q9H000 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MKRN2Q9H000 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKRN2Q9H000 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms