Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CNTNAP4Q9C0A0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CNTNAP4Q9C0A0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CNTNAP4Q9C0A0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CNTNAP4Q9C0A0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CNTNAP4Q9C0A0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CNTNAP4Q9C0A0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CNTNAP4Q9C0A0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CNTNAP4Q9C0A0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CNTNAP4Q9C0A0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CNTNAP4Q9C0A0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CNTNAP4Q9C0A0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CNTNAP4Q9C0A0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CNTNAP4Q9C0A0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CNTNAP4Q9C0A0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CNTNAP4Q9C0A0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CNTNAP4Q9C0A0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CNTNAP4Q9C0A0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CNTNAP4Q9C0A0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms