Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTNAP3Q9BZ76 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTNAP3Q9BZ76 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP3Q9BZ76 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP3Q9BZ76 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP3Q9BZ76 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP3Q9BZ76 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP3Q9BZ76 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP3Q9BZ76 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP3Q9BZ76 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP3Q9BZ76 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP3Q9BZ76 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms