Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RNF17Q9BXT8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RNF17Q9BXT8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RNF17Q9BXT8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RNF17Q9BXT8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
RNF17Q9BXT8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
RNF17Q9BXT8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RNF17Q9BXT8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RNF17Q9BXT8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RNF17Q9BXT8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RNF17Q9BXT8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RNF17Q9BXT8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
RNF17Q9BXT8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RNF17Q9BXT8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RNF17Q9BXT8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RNF17Q9BXT8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RNF17Q9BXT8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
RNF17Q9BXT8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RNF17Q9BXT8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RNF17Q9BXT8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RNF17Q9BXT8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RNF17Q9BXT8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RNF17Q9BXT8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RNF17Q9BXT8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RNF17Q9BXT8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RNF17Q9BXT8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RNF17Q9BXT8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RNF17Q9BXT8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RNF17Q9BXT8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RNF17Q9BXT8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RNF17Q9BXT8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RNF17Q9BXT8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
RNF17Q9BXT8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RNF17Q9BXT8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RNF17Q9BXT8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms