Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX67

JAM3, Junctional adhesion molecule C, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM3Q9BX67 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
JAM3Q9BX67 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
JAM3Q9BX67 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms