Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.29■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REPIN1Q9BWE0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REPIN1Q9BWE0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REPIN1Q9BWE0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms