Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MKNK1Q9BUB5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKNK1Q9BUB5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MKNK1Q9BUB5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKNK1Q9BUB5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MKNK1Q9BUB5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKNK1Q9BUB5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKNK1Q9BUB5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKNK1Q9BUB5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MKNK1Q9BUB5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKNK1Q9BUB5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MKNK1Q9BUB5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKNK1Q9BUB5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKNK1Q9BUB5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKNK1Q9BUB5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKNK1Q9BUB5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKNK1Q9BUB5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKNK1Q9BUB5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKNK1Q9BUB5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKNK1Q9BUB5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms