Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM43Q9BTV4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM43Q9BTV4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM43Q9BTV4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms