Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
H2AFJQ9BTM1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFJQ9BTM1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2AFJQ9BTM1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2AFJQ9BTM1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms