Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD6Q9BRQ6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHCHD6Q9BRQ6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHCHD6Q9BRQ6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD6Q9BRQ6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD6Q9BRQ6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD6Q9BRQ6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD6Q9BRQ6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHCHD6Q9BRQ6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD6Q9BRQ6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD6Q9BRQ6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD6Q9BRQ6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD6Q9BRQ6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD6Q9BRQ6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHCHD6Q9BRQ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD6Q9BRQ6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD6Q9BRQ6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD6Q9BRQ6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD6Q9BRQ6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD6Q9BRQ6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHCHD6Q9BRQ6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHCHD6Q9BRQ6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHCHD6Q9BRQ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms