Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
BPIFA3Q9BQP9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BPIFA3Q9BQP9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BPIFA3Q9BQP9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms