Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PMCHL2Q9BQD1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PMCHL2Q9BQD1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMCHL2Q9BQD1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms