Protein–RNA interactions for Protein: Q99829

CPNE1, Copine-1, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE1Q99829 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPNE1Q99829 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPNE1Q99829 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPNE1Q99829 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPNE1Q99829 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPNE1Q99829 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPNE1Q99829 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPNE1Q99829 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CPNE1Q99829 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms