Protein–RNA interactions for Protein: Q99805

TM9SF2, Transmembrane 9 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF2Q99805 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM9SF2Q99805 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF2Q99805 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM9SF2Q99805 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM9SF2Q99805 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM9SF2Q99805 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM9SF2Q99805 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM9SF2Q99805 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM9SF2Q99805 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM9SF2Q99805 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM9SF2Q99805 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TM9SF2Q99805 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms