Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SIGMAR1Q99720 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms