Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBBP8Q99708 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBBP8Q99708 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RBBP8Q99708 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms