Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A3Q99624 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC38A3Q99624 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms