Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC1Q99614 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC1Q99614 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC1Q99614 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC1Q99614 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC1Q99614 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC1Q99614 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC1Q99614 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC1Q99614 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC1Q99614 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC1Q99614 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC1Q99614 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC1Q99614 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC1Q99614 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC1Q99614 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC1Q99614 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC1Q99614 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC1Q99614 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC1Q99614 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC1Q99614 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms